Le CNRT a les mandats suivants:

• Diagnostic de référence pour la borréliose de Lyme et la fièvre Q
• Expertise sur d’autres maladies transmises par les tiques
• Fournir des matériaux de référence
• Assurance de qualité et recherche dans le domaine du développement de tests
• Formation de personnel spécialisé et des non-professionnels
• Conseil scientifique
• Coopération nationale et internationale et soutien du réseau

La prestation du CNRT est périodiquement contrôlée par le groupe consultatif du CNRT institué par l’OFSP.