Das Mandat des BAG beinhaltet ausschliesslich Borrelia burgdorferi sensu lato und Coxiella burnetii. Die Diagnostik für andere durch Zecken übertragene Krankheitserreger ist nicht Bestandteil der Referenzfunktion. Diese Analysen werden gemäss eidgenössischer Analysenliste des BAG verrechnet.